從視網(wǎng)膜的光感錐體到心臟的抽血肌肉到腎臟的廢物過濾單元,人體由數(shù)百種細(xì)胞組成,精細(xì)地專門用于高精度地完成它們的工作。
然而,這種復(fù)雜性掩蓋了這樣一個(gè)事實(shí),即數(shù)萬(wàn)億個(gè)高度專業(yè)化的細(xì)胞中的每一個(gè)都是作為單個(gè)原始細(xì)胞開始的。
這些原始的,未分化的細(xì)胞如何選擇他們的*終命運(yùn)?幾個(gè)世紀(jì)以來,這個(gè)問題引起了生物學(xué)界的關(guān)注。
現(xiàn)在,來自哈佛醫(yī)學(xué)院,卡羅林斯卡醫(yī)學(xué)院和維也納醫(yī)科大學(xué)以及其他機(jī)構(gòu)的科學(xué)家們已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了有關(guān)細(xì)胞分子邏輯的有趣新線索,這些線索可以告知他們的命運(yùn)。
這項(xiàng)發(fā)現(xiàn)于6月7日發(fā)表在“科學(xué)”雜志上,基于對(duì)小鼠神經(jīng)嵴組織的研究,表明細(xì)胞在成年之旅中面臨著多種競(jìng)爭(zhēng)選擇,并在達(dá)到*終目的地之前執(zhí)行一系列二元決策。
“一個(gè)祖細(xì)胞可以成為任何東西,但這種選擇是如何實(shí)現(xiàn)的?”哈佛醫(yī)學(xué)院Blavatnik研究所生物醫(yī)學(xué)信息學(xué)副教授,共同高級(jí)研究員Peter Kharchenko說。“我們的研究代表了一種定義細(xì)胞選擇背后的分子邏輯的嘗試。我們相信我們的研究結(jié)果可以幫助我們了解細(xì)胞如何將自己定位于特定的命運(yùn)以及細(xì)胞分化過程中可能出現(xiàn)的問題。”
研究表明,神經(jīng)嵴細(xì)胞的決定分三個(gè)階段進(jìn)行:競(jìng)爭(zhēng)遺傳程序的激活爭(zhēng)奪細(xì)胞的注意力,逐漸偏向其中一個(gè)程序和細(xì)胞的*終承諾。
研究人員警告說,在這一點(diǎn)上,他們的研究結(jié)果僅與神經(jīng)嵴細(xì)胞有關(guān),但可以探索相同的方法來了解其他組織中的細(xì)胞分化。他們補(bǔ)充說,尚不清楚其他組織,器官和生物是否遵循類似的細(xì)胞分化機(jī)制。
研究人員說,除了揭示生物學(xué)中的一個(gè)基本問題之外,這項(xiàng)研究結(jié)果還可以幫助說明干細(xì)胞中出現(xiàn)的錯(cuò)誤,這種干細(xì)胞“走錯(cuò)了路”并變得惡化,或者為生長(zhǎng)用于治療的人工神經(jīng)組織提供新技術(shù)。
“我們希望我們的研究結(jié)果可以為神經(jīng)嵴細(xì)胞的多樣性提供一個(gè)新的窗口,并有助于解釋導(dǎo)致顱面,心臟和感覺組織的細(xì)胞的正常發(fā)育,以及導(dǎo)致顱面,心臟和感覺組織的一些病理性”彎路“。研究共同資深作者,卡羅林斯卡醫(yī)學(xué)院和維也納醫(yī)科大學(xué)的高級(jí)研究員Igor Adameyko說,細(xì)胞分化異常。“這些見解不僅對(duì)理解細(xì)胞分化的基礎(chǔ)生物學(xué)至關(guān)重要,而且可能對(duì)未來的治療策略有所了解。”
細(xì)胞的困境
研究人員追蹤了來自小鼠神經(jīng)嵴組織的原始細(xì)胞的軌跡 - 這是由外胚層產(chǎn)生的細(xì)胞集合,外胚層是胚胎發(fā)育過程中形成的主要生殖細(xì)胞層。這些祖細(xì)胞產(chǎn)生多種細(xì)胞,包括大腦,脊髓和身體其他部位的不同神經(jīng)細(xì)胞,產(chǎn)生色素的細(xì)胞以及構(gòu)成頭骨和面部的骨骼,軟骨和平滑肌細(xì)胞。 。
為了追溯這些原始細(xì)胞在分化到不同專業(yè)領(lǐng)域時(shí)的決策,研究人員使用單細(xì)胞測(cè)序技術(shù),這種技術(shù)可以讓人們觀察單個(gè)細(xì)胞的遺傳變化,一次一個(gè)細(xì)胞。研究人員以決策樹的形式繪制了細(xì)胞的軌跡,并在道路上以一系列叉子為標(biāo)志。為了確定細(xì)胞決定的順序以及它如何承諾給定的命運(yùn),科學(xué)家們追蹤了單個(gè)細(xì)胞中RNA變化的速度。RNA變化 - 通過基因表達(dá)和蛋白質(zhì)產(chǎn)生速率的變化來衡量 - 發(fā)生在細(xì)胞開始從基因進(jìn)行行進(jìn)命令并轉(zhuǎn)化自身時(shí)。隨著遺傳程序被激活或沉默,RNA產(chǎn)生的速率也相應(yīng)地發(fā)生變化。
令研究人員驚訝的是,分析顯示,競(jìng)爭(zhēng)的基因組 - 調(diào)節(jié)各種細(xì)胞功能的遺傳程序 - 同時(shí)將細(xì)胞推向不同的發(fā)育途徑。當(dāng)細(xì)胞決定路徑時(shí),一個(gè)遺傳程序變得更強(qiáng),而競(jìng)爭(zhēng)程序變得更弱,允許細(xì)胞移動(dòng)到其選擇的路徑。
分析表明,細(xì)胞面臨一系列二元選擇,隨后的每一個(gè)決定都會(huì)進(jìn)一步縮小專業(yè)化的選擇范圍。例如,分析表明,當(dāng)神經(jīng)嵴細(xì)胞必須選擇是否會(huì)成為感覺神經(jīng)細(xì)胞或其他類型時(shí),細(xì)胞行程的次分叉發(fā)生在交叉點(diǎn)。在路上的下一個(gè)岔路口,神經(jīng)細(xì)胞必須決定成為膠質(zhì)細(xì)胞 - 一種支持和屏蔽神經(jīng)元的細(xì)胞 - 或神經(jīng)元,依此類推,直到達(dá)到*終狀態(tài)。
科學(xué)家想要回答的下一個(gè)問題是如何將細(xì)胞引向特定的命運(yùn)。
“細(xì)胞是否會(huì)慢慢開始激活分子機(jī)器,將其推向正確的道路或是否還有其他事情發(fā)生?”哈爾琴科說。
研究結(jié)果表明,個(gè)體基因不會(huì)相互獨(dú)立地偏向細(xì)胞的選擇。相反,與不同命運(yùn)相關(guān)的整個(gè)基因簇同時(shí)被激活并爭(zhēng)奪細(xì)胞的注意力。細(xì)胞越接近決策叉,兩個(gè)遺傳程序的共同激活就越大,每個(gè)遺傳程序都向不同方向招募細(xì)胞 - 例如,成為顎骨細(xì)胞與神經(jīng)細(xì)胞之間的決定。
觀察結(jié)果表明,只有在兩個(gè)程序都被部分激活后,一個(gè)單元才會(huì)做出選擇,在提交之前為兩個(gè)備選方案啟動(dòng)單元。一旦做出選擇,無關(guān)的遺傳程序就會(huì)被沉默。
“這是相當(dāng)令人驚訝的,”Kharchenko說。“我們希望看到一些更簡(jiǎn)單的東西,比如細(xì)胞顯示早期偏好一種選擇而不是另一種選擇。相反,我們觀察到細(xì)胞準(zhǔn)備兩種選擇,考慮兩種選擇,然后才做出決定。”
Adameyko說,研究結(jié)果表明,“一個(gè)復(fù)雜的,長(zhǎng)期存在沖突信號(hào)的歷史逐漸為細(xì)胞準(zhǔn)備了一系列可能的結(jié)果,這一過程*終將這些選擇升華為一個(gè)可用的選擇。”
研究人員警告說,他們的研究結(jié)果揭示了細(xì)胞的內(nèi)部決策以及如何執(zhí)行決策,而不是實(shí)際指導(dǎo)*終選擇的因素。該團(tuán)隊(duì)表示,這些因素很可能是來自細(xì)胞環(huán)境的外部信號(hào),而不是來自內(nèi)部的信號(hào)。但是,電池必須準(zhǔn)備好在它們到達(dá)時(shí)響應(yīng)相關(guān)的外部信號(hào)。
“我們看到的是細(xì)胞如何為這一決定做好準(zhǔn)備,并準(zhǔn)備應(yīng)對(duì)一個(gè)或另一個(gè)電話,”Kharchenko說。“有些東西將電池推向一個(gè)方向,但我們?nèi)匀徊恢来呋瘎┦鞘裁础?rdquo;
轉(zhuǎn)向正確的道路
這些觀察結(jié)果可以幫助科學(xué)家了解細(xì)胞如何成熟以發(fā)揮其作用,但同樣重要的是,他們?nèi)绾纹x病程并開始無法控制地分裂 - 這是癌癥的主要特征。例如,這些發(fā)現(xiàn)可以闡明作為腫瘤細(xì)胞群多樣性的基礎(chǔ)的過程和某些稱為成神經(jīng)細(xì)胞瘤的神經(jīng)母細(xì)胞瘤的治療抗性,這些腫瘤是由未成熟的神經(jīng)細(xì)胞引起的。
幾種類型的癌癥源自神經(jīng)嵴譜系,包括外周神經(jīng)系統(tǒng)的腫瘤,一些內(nèi)分泌腫瘤和黑素瘤。研究人員表示,盡管細(xì)胞特化是一個(gè)嚴(yán)格控制的過程,但可能會(huì)出現(xiàn)分化錯(cuò)誤,導(dǎo)致惡性腫瘤。
“有一些跡象表明神經(jīng)嵴腫瘤是由細(xì)胞無法克服道路上的分化叉而產(chǎn)生的,并且卡住了,”Kharchenko說。“向前邁進(jìn),我們想知道細(xì)胞在什么時(shí)候脫離其預(yù)定的路徑并開始過度擴(kuò)散。”
研究人員表示,對(duì)人類神經(jīng)嵴組織進(jìn)行類似的分析,以詳細(xì)說明在這些關(guān)鍵時(shí)刻發(fā)生的精確分子事件 - 以及細(xì)胞如何解決或無法解決它們 - 將是了解遺傳變化的重要下一步伴隨正常和異常分化的程序。