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一.實驗原理
質粒可攜帶一種或多種抗生素抗性基因,其賦予攜帶它們的細菌對特定抗生素的抗性。研究人員可以通過人工選擇(即在抗生素存在下培養(yǎng)細菌),輕松地將含有該質粒的細菌與不含有該細菌的細菌分離。
Luria肉湯(LB)是一種富含營養(yǎng)的培養(yǎng)基,通常用于培養(yǎng)實驗室中的細菌。向LB中添加瓊脂導致形成細菌可以生長的凝膠,因為它們不能消化瓊脂但可以從LB內收集營養(yǎng)。向該凝膠中添加抗生素只允許選擇那些對該抗生素具有抗性的細菌 - 通常由攜帶抗生素抗性基因的質粒賦予。
LB瓊脂平板經(jīng)常用于分離攜帶特定質粒的細菌的個體菌落。然而,液體培養(yǎng)物能夠支持更高密度的細菌,并用于培養(yǎng)足夠數(shù)量的細菌以分離足夠的質粒DNA用于實驗用途。
二.試劑及實驗器材準備
1.液體培養(yǎng)基配制:
胰蛋白胨Tryptone:10g
酵母粉Yeast:5g
NaCl:10g
dH2O定容至1000ml
2.LB平板配制:
胰蛋白胨Tryptone:10g
酵母粉Yeast:5g
NaCl:10g
瓊脂糖:12g(工作濃度6-25g/L)
dH2O定容至1000ml
3.無菌平板(不可高壓):通常使用60 mm x 15 mm平板,200ml瓊脂澆筑4-5個平板(若瓊脂太少過夜孵育后容易干裂),可在其上單獨區(qū)分*多約100個菌落
4. Falcon細胞流式管(不可高壓)5.可高壓滅菌的燒瓶:(用1L瓶制備400ml瓊脂,在500ml瓶中制備200ml瓊脂,需要額外的空間防止沸騰。)
6.抗生素:1000倍的儲備溶液(氨芐青霉素鈉,庫存濃度100mg/ml,溶解后,0.22um過濾除菌,分裝,-20℃保存數(shù)月。加入培養(yǎng)基時一定要等滅菌后的培養(yǎng)基冷卻到40-50℃時再加入。含氨芐青霉素的培養(yǎng)基平板在4℃可保存2周。)
三.實驗步驟
1.溶解質粒: 將含目的基因質粒的 紙剪下(比畫得圈稍大),并剪成碎片,放入無菌EP管,加20到50ul無菌水或TEbuffer, 可用槍頭將濾紙搗碎,室溫過夜(或為了促溶,還可60℃水。。后漩渦振蕩5min,離心,取上清即為質粒用于后續(xù)轉化。
2.LB液體培養(yǎng)基、LB平板粉末 攪拌溶解后,121℃高壓滅菌半小時,高壓滅菌過程中高壓釜膠帶會變暗。液體LB 無菌環(huán)境下冷卻至室溫,放置4℃冰箱備用;LB平板 熔融凝膠混合物在凝固前轉入40-50℃(視抗生素加入培養(yǎng)基溫度而定)水浴鍋,至少5分鐘,備用。
3.準備培養(yǎng)皿、Falcon細胞流式管,紫外線消毒30min;(在培養(yǎng)皿上標記日期、抗生素特性。)
4.準備抗生素(要制備終濃度為100 ug/mL氨芐青霉素鈉的平板,則應制備100,000 ug / mL(100 mg / mL)的儲備溶液。測量100毫克氨芐青霉素鈉粉末,將其加入1毫升水中,通過渦旋溶解,并過濾滅菌。)
5.添加抗生素至LB液體培養(yǎng)基、LB平板熔融凝膠混合物中(溫度不宜過高,40-50℃(視抗生素分解溫度而定,氨芐青霉素鈉加入溫度為40-50℃),防止抗生素分解)
6.澆筑LB平板:澆注后將盤子旋轉以除去氣泡,確保瓊脂在板底部均勻分布,凝固后倒置。200ml瓊脂澆筑4-5個平板(若瓊脂太少——板過薄,過夜孵育后容易干裂)若澆筑過程瓶中的瓊脂凝固,可再次通過高壓滅菌器或微波爐將瓊脂重新液化(用微波爐時防止沸騰。┦覝叵鹿袒蠹s需要30min,在室溫下過夜使之干燥。在過夜干燥后,將板在4℃下(用PE手套包好)儲存直至使用。
7.取感受態(tài)細胞置于冰浴中,如需分裝可將剛融化細胞懸液分裝到無菌預冷(提前冰上預冷1.5mlEp管)的離心管中,置于冰浴中。
注意:一次轉化感受態(tài)細胞的建議用量為50-100ul,可以根據(jù)實際情況分裝。所用DNA體積不超過感受態(tài)細胞懸液體積的1/10。(根據(jù)加入質粒體積提前準備無菌10ul無濾芯槍頭)
8. 向感受態(tài)細胞懸液中加入目的DNA/ pUC19質粒(對照:證實感受態(tài)細胞是否有問題)(100ul的感受態(tài)細胞能夠被1ng超螺旋質粒DNA所飽和),輕彈混勻,在冰浴中靜置30min。
9. 將離心管置于42℃水浴中放置60-90s,然后快速將管轉移到冰浴中,使細胞冷卻2-3min,該過程不要搖動離心管。
注意:此步驟也可將離心管置于室溫進行,夏季或室溫較高時,可放置5-8min, 如果室溫較低,可延長時間至8-15min。條件允許建議使用42℃熱激方法。
10. 向每個離心管中加入900ul無菌的LB培養(yǎng)基 (不含抗生素),混勻后置于37℃搖床振蕩培養(yǎng)45 min (將1.5mlEp管水平放置,充分搖混勻),目的是使質粒上相關的抗性標記基因表達,使菌體復蘇。
11. 將離心管內容物混勻,吸取100ul (次涂板,可設置不同的梯度:20ul、50ul、70ul、100ul)已轉化的感受態(tài)細胞加到含相應抗生素的LB固體培養(yǎng)基上,用無菌的彎頭玻棒輕輕的將細胞均勻涂開。將平板置于室溫直至液體被吸收(15-20min),倒置平板,37℃培養(yǎng)12-16h(過夜)。
注意:涂布用量可根據(jù)具體實驗來調整。如轉化的DNA總量較多,可取更少量轉化產(chǎn)物涂布平板;反之,如轉化的DNA總量較少,可取200-300ul轉化產(chǎn)物涂布平板。如果預計的克隆較少,可通過離心(4000rpm, 2min)后吸除部分培養(yǎng)液,懸浮菌體后將其涂布于一個平板中。(涂布剩余的菌液可置于4℃保存,如果次日的轉化菌落數(shù)過少可以將剩下的菌液再涂布新的培養(yǎng)板。)
12. 使用無菌槍頭或牙簽,從LB瓊脂平板上選擇一個菌落。
13. 將槍頭或牙簽放入液體LB +抗生素中并旋轉。
14. 將細菌培養(yǎng)物在37℃下在振蕩培養(yǎng)箱中 180rpm孵育12-18h。
15. 孵育后,檢查生長,其特征在于培養(yǎng)基中的混濁霧度。
注意:良好的陰性對照是LB培養(yǎng)基+抗生素,沒有任何細菌接種。過夜孵化后,您應該看到這種培養(yǎng)物沒有生長。
對于細菌的長期儲存,選擇甘油。
1、配制30%(體積分數(shù))的甘油水溶液,離心管若干滅菌備用.
2 、將細菌用富集培養(yǎng)基搖瓶培養(yǎng)過夜,根據(jù)保藏要求(有些要求高的項目中菌要達到一定OD值)培養(yǎng).
3 、將菌液和滅菌的甘油水溶液按照2:1的體積比例在離心管中混勻(使*終甘油濃度為10%,其實甘油多點也沒關系),-70°冰箱保存.
16. 用小提試劑盒從大腸桿菌培養(yǎng)物中分離質粒DNA。
17. 樣品進行電泳檢測:1%瓊脂糖凝膠電泳,上樣量為2ul,紫外燈下觀察,*明亮的帶為超螺旋形式,可以在一定程度上表明提取質粒的純度。
18. 質粒純化
1) 將之前提取好的質粒放入1.5ml離心管中,加入1/10體積的3mol/L無菌乙酸鈉溶液。
2) 加入2倍體積的無水乙醇,放置于-20℃沉淀4-6h或過夜。
3) 4℃,高速離心機14000rpm,離心20min.
4) 棄去上清,70%乙醇洗2次。
5) 空氣干燥,可置超凈工作臺干燥。
6) 加200ul無菌水溶液干燥后所得沉淀,即為質粒溶液。
7) 紫外分光光度計測量質粒濃度和產(chǎn)量。
四.提示和常見問題
(1)高拷貝質粒和低拷貝質粒有什么區(qū)別?
拷貝數(shù)是指單個細菌細胞內單個質粒的拷貝數(shù)。大質粒通常具有低拷貝數(shù)(每個細胞大約一個或兩個拷貝)并且它們需要生長更長的時間段(大約18-30小時)。另一方面,較小的質?梢源罅看嬖,每個細胞50個或更多,并且具有高拷貝數(shù)。高拷貝數(shù)質粒應該僅需要平均生長12-16小時。無論質粒大小如何,質粒的某些特征可使其低拷貝。請參閱質粒的信息頁面以確定您的質粒是高拷貝還是低拷貝。
(2)過夜孵化后,我沒有任何增長。什么地方出了錯?
嘗試將文化培養(yǎng)更多時間。一些細菌培養(yǎng)物生長得更慢。此外,在30°C而不是37°C溫育的細菌通常需要更長的孵育時間。
仔細檢查LB培養(yǎng)基中的抗生素是否與質粒上的抗生素抗性相匹配。
如果LB瓊脂平板上的細菌不是新鮮的,你應該將細菌劃到新的LB瓊脂平板上,然后在液體培養(yǎng)基中生長。
更多的曝氣可能有助于增加培養(yǎng)物的密度。通常培養(yǎng)物在150-250rpm下?lián)u動,將其增加至350-400rpm以獲得更高的細胞密度。
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